Voor deze opdracht was er een architectuurwedstrijd uitgeschreven door de provincie West-Vlaanderen en ANB (Agentschap Natuur en Bos), die samen het domein zullen beheren en uitbaten. De jury, onder leiding van de Italiaanse architect Bernardo Secchi, koos voor het ontwerp van Grontmij en Coussée & Goris omdat het door zijn horizontale structuur zo perfect geïntegreerd is in het landschap.

Het natuurcentrum zal uit twee delen bestaan: een bezoekerscentrum en een kijkcentrum. In het bezoekerscentrum komen er behalve een grote interactieve tentoonstelling nog een cafetaria, seminarievoorzieningen met een restaurant en een documentatiecentrum, waar de bezoekers meer informatie kunnen krijgen over wat er in het domein te ontdekken valt. Totaal losstaand hiervan, en als het ware ingewerkt in de dijk wat verderop, komt het kijkcentrum bestaande uit hout (binnen) en beton (buiten). Het is de bedoeling dat dit beton met de tijd gaat verweren en deel wordt van het landschap.

Zowel de provincie als ANB willen het nieuwe Zwin uitbouwen tot een absolute topattractie aan de kust. Gedurende de werken zal het Zwin openblijven.